Mac安装FreeSurfer

在https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/MacOsInstall 中下载软件安装

安装好之后，在terminal中输入：

export FREESURFER_HOME=/Applications/freesurfer

source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

然后在这个网站下载license：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html

license.txt会被发送到填好的邮箱，把它复制粘贴到FREESURFER_HOME中就好。

接下来可以测试FreeSurfer是否安装好：

https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/DownloadAndInstall#TestyourFreeSurferInstallation

例如：

cp $FREESURFER_HOME/subjects/sample-001.mgz .

mri_convert sample-001.mgz sample-001.nii.gz

输出结果应该是：

reading from sample-001.mgz...

TR=7.25, TE=3.22, TI=600.00, flip angle=7.00

i_ras = (-0, -1, -0)

j_ras = (-0, 0, -1)

k_ras = (-1, 0, 0)

writing to sample-001.nii.gz...

大功告成！