R语言复习相关

热图绘制-fold change值-R

2018-09-25  本文已影响9人  小灰灰want_to_fly

setwd("D:/Desktop/all")    #设置工作目录,处理fold值数据

library("pheatmap")    #加载pheatmap包

data = read.csv('a1.csv',row.name=1)    #将文件a1.csv读入到data中

data[data< -3]=-3    #对fold值进行处理,小于-3的均写成-3

data[data>3]=3     #对fold值进行处理,大于3的均写成3

pdf("a1.pdf")     #将热图存入文件名为a1.pdf中,也可不先输出,使用下一条语句查看热图情况

pheatmap(data)     #绘制热图

dev.off()     #保存并关闭文件

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