GEO数据下载及读取时遇到的问题

2021-11-12  本文已影响0人  小白兔和小毛驴

read.table读入文件时,当文本中有空值时

anno<-read.table("anno_GPL6480.txt",header = T,  sep ="\t",dec = ".",quote="",comment.char = "" ,na.strings = c("NA"),fill=T)

GEOquery包的getGEO函数无法下载 无法与服务器建立连接

通常只有的网络错误,都很诡异,毕竟长城在这里。

解决方式也简单,加上代码: options( 'download.file.method.GEOquery' = 'libcurl' )     即可

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