最新影像组学多模态模型预测肺癌新辅助免疫化疗 作者开源模型 可以

2025-08-05  本文已影响0人  生信探索
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2024年一项发表于《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》的多中心研究显示,通过术前平扫+增强CT构建的深度学习模型(LUNAI-fCT),可无创、精准预测患者病理完全缓解(pCR),为临床决策提供重要参考。


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作者预训练的肺癌CT专用基础模型FM-LCT (https://github.com/zhenweishi/FM-LCT) 已经开源,可以用于自己研究中直接提取特征或者经过微调后再提取特征

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一、数据来源

多中心回顾性队列,覆盖113例训练+112例外部验证 本研究为回顾性多中心研究,纳入2019年8月至2023年2月期间,国内4家中心(A、B、C、D)接受新辅助免疫化疗后手术的NSCLC患者。
纳入标准:经病理证实为NSCLC(IB-III期),完成至少2周期新辅助免疫化疗,术后有完整病理评估,且有术前平扫及增强CT图像。
排除标准:CT图像缺失或质量不佳、CT检查距治疗开始超过1个月、临床病理资料不全。 最终,113例患者来自中心A(按8:2划分为训练集与内部验证集),112例患者来自中心B(73例)、C(20例)、D(19例)作为外部测试集,确保模型的外部泛化能力。

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二、模型构建:从CT图像到预测模型,四步实现精准特征挖掘

1. 数据预处理:标准化图像,确保特征一致性

2. 特征提取

采用肺癌CT专用预训练基础模型FM-LCT(https://github.com/zhenweishi/FM-LCT) 提取深度特征。该模型通过掩码自编码器(MAE)对比学习算法,在大规模、多类型肺癌CT数据集上训练,可自动捕捉肿瘤异质性、血管生成等关键生物学特征。

3. 模型训练:降维+随机森林,构建三种预测模型

三、模型结果

融合模型性能最优,AUC达0.866 在外部测试集(112例)中,三种模型的表现如下:

模型 AUC(95%CI) 准确率 敏感性 特异性 阴性预测值
LUNAI-uCT 0.762(0.654-0.791) 0.676 0.958 0.532 0.962
LUNAI-eCT 0.797(0.724-0.844) 0.716 0.833 0.660 0.892
LUNAI-fCT 0.866(0.821-0.883) 0.800 0.917 0.739 0.944
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融合模型(LUNAI-fCT)的Immu-TR评分(预测pCR的概率)在pCR与非pCR组间差异显著,Kolmogorov-Smirnov检验KS值达0.825(P<0.001),提示其区分能力优异;

亚组分析(按年龄、吸烟状态、临床分期)显示,融合模型在各亚组中均保持稳定性能。

模型解释

用SHapley Additive exPlanations(SHAP)分析量化各CT特征对预测的贡献;


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