生信星球培训第八期

学习小组Day5笔记——四海

2018-10-26  本文已影响21人  寂静之巅

R语言第二天——R基础

数据类型

part1:向量

x <- c(1,2,3) #定义向量的写法
x <- c(1:10) #从1-10取整数
x <- seq(1,10,by = 0.5)
x <- seq(1,10,by = 0.8)
x <- rep(1:3,times = 2)

提取向量中的元素

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

part2:数据框

  1. 读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件,分隔符为Tab,有表头 

a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a 

这是正规的读取数据的方法

  1. 设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
  1. 数据框的导出
    write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
  2. 变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令

5 提取元素

X[x,y]#第x行第y列
 X[x,]#第x行
X[,y]#第y列(横着写,这是不够懒也不够优秀却能存在的写法)
X[y] #第y列(竖着写,这是懒惰又优秀的写法)
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列

思维导图

今天换了电脑,宿舍电脑没有思维导图软件,今天偷个懒,就不做了,本想着明天早上去实验室把思维导图不上,因为明天早上有个足球赛,回来肯定晚了。先把作业交了。

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