github的包安装不了怎么办（介绍Y叔的一个神包）？
2020-08-28 本文已影响0人
Kevin_Hhui
在使用R语言进行数据分析时，我们时不时需要下载github中的R包，但是相信大家经常会遇到一个问题——总是安装失败。原因大都因为网络原因，但是github的网页总是能够上的，而网页上点击Download ZIP也是可以的。相信这个问题困扰了不少人。我们经常的解决方法是通过码云进行间接下载，然后再从本地安装。确实，问题是解决了，但是步骤繁琐，对于追求高效率的同学来说，这是不可接受的，正巧今天偶尔看到Y叔的一个神包，很好的解决了这个问题。
废话不多说，开始介绍：
相关函数存在yulab-smu/yulab.utils包中（https://github.com/YuLab-SMU/yulab.utils）。因为我们还没有装这个包，所以我们先利用码云将yulab.utils包下载下来，接着本地安装。
yulab.utils包下载
本地安装
yulab.utils包顺利安装完成，可以使用Y叔的那两个函数了--install.zip()函数和install_zip_gh()函数
（一）install.zip()函数
该函数可以直接根据github下载得到的压缩包，进行解压，编译和安装。你只需要给这个函数一个R压缩包即可。用法也极其简单，就install.zip(“R package.zip”)。
举例：
library(yulab.utils) #加载yulab.utils包
##需要注意的是工作目录下必须有ggtree.zip文件
install_zip("ggtree.zip")
> install_zip("ggtree.zip")
✔ checking for file ‘/tmp/RtmpHiXVWl/file3ea34246ccb64/ggtree/DESCRIPTION’ ...
─ preparing ‘ggtree’:
✔ checking DESCRIPTION meta-information ...
─ checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
─ checking for empty or unneeded directories
─ building ‘ggtree_2.1.6.tar.gz’
Installing package into ‘/home/ygc/R/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
inferring 'repos = NULL' from 'pkgs'
* installing *source* package ‘ggtree’ ...
** using staged installation
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (ggtree)
library(ggtree) #查看ggtree是否安装成功
（二）install_zip_gh()函数
这个函数类似于devtools::install_github()，它可以直接去下载zip包，这样避免无法访问github的问题。下载好zip包后，它再调用install_zip()进行编译安装。
真的一条命令搞定github R包的安装。
值得注意的是，install_zip_gh()函数依赖downloader.R，如果有同学发现报错说缺少downloader，则直接利用 install.packages('downloader')就行了。
library(yulab.utils)
##这里拿Y叔的ggtree来演示
install_zip_gh("yulab-smu/ggtree")
> install_zip_gh("yulab-smu/ggtree")
trying URL 'https://codeload.github.com/yulab-smu/ggtree/zip/master'
downloaded 327 KB
checking for file ‘/tmp/RtmpHiXVWl/file3ea34c0f3725/ggtree-master/DESCRIPTION✔ checking for file ‘/tmp/RtmpHiXVWl/file3ea34c0f3725/ggtree-master/DESCRIPTION’
─ preparing ‘ggtree’:
✔ checking DESCRIPTION meta-information ...
─ checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
─ checking for empty or unneeded directories
─ building ‘ggtree_2.1.6.tar.gz’
Installing package into ‘/home/ygc/R/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
inferring 'repos = NULL' from 'pkgs'
* installing *source* package ‘ggtree’ ...
** using staged installation
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (ggtree)
library(ggtree) #查看ggtree是否安装成功
至此，这两个函数介绍完毕，大家以后在下载github的包时，再也不用担心啦。
