什么是RIN值？

样本提取是实验关键一环，没有好的样本，一切数据就犹如没有地基的大厦，盖得越高，倾覆的概率就会越大！所以开展好一个实验，首先要从评价核酸质量是否达标开始，RIN值是样本检测中比较重要的...

样本提取是实验关键一环，没有好的样本，一切数据就犹如没有地基的大厦，盖得越高，倾覆的概率就会越大！所以开展好一个实验，首先要从评价核酸质量是否达标开始，RIN值是样本检测中比较重要的指标，今天就给大家聊聊RIN值！

RIN值简介

RIN值，即RNA integrity number（RNA完整值），是安捷伦公司开发的以数字化形式表示 RNA 完整性的参数。在高通量测序样本检测报告中经常出现，用来衡量样品中抽提的RNA的质量；了解RIN值需先了解下28S和18S比值。 28S和18S比值：28s和18s是真核生物RNA（核糖体RNA）的两个主要亚基，在完整性较好的RNA样本电泳条带上应是28S在上，18S在下，且亮度为28S是18S的两倍，理论上未发生降解的RNA样本28S/18S比值等于2.0；但在实际取样提取过程中，RNA可能会发生各种途径的降解，体现在电泳条带上就是28S/18S比值会下降；此前，研究者们已将核糖体比值作为特征值应用在生物分析仪软件中，用来表征凝胶分析中RNA 的完整性。然而，仅通过总RNA的核糖体比值去评估RNA的完整性通常不准确，而Agilent 2100生物分析仪系统通过显示RNA片段大小分布的详细画面（下图），能更好的评估RNA完整性。

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注：总RNA样品经过不同时间降解，并且在Agilent 2100生物分析仪系统上使用真核细胞总RNA Nano分析法分析所得的样品；随着降解推进，可以观察到向较短片段大小方向偏移。RNA降解是一个逐渐的过程，随着降解推进，18S/28S核糖体条带比减小，而两个核糖体峰和下位内标之间的基线信号增大（图1）。RNA完整值（RIN）这一指标，就是基于整体电泳图，将真核生物总RNA质量分类，并设定RIN数值范围为1-10，其中1代表降解最严重的情况，10代表最完整。通过这种方式，有助于解释电泳图，令样品之间的比较成为可能，并确保实验的重复性。更多详细信息参见安捷伦公司的应用简报，链接：https://wenku.baidu.com/view/90ab7b29370cba1aa8114431b90d6c85ed3a8887.html。

不同物种RIN形式

动物样品胶图上可见目的条带为28S、18S、5S，植物样品为25S、18S、5S，昆虫、软体动物等是18S、5S，原核生物是23S、16S、5S。

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所以不同物种的Agilent 2100 数据显示还是有一点点差别的，差别主要是25S、23S等的区别。

安捷伦2100结果怎么看？

理想的电泳图可以展示以下要素信息：前区、5S区、快速区、中区、前体区、后区以及3个高耸的标准品峰、18S峰、28S峰。

attachments-2020-09-FxZ2dF2O5f5587fed181f.png 不同降解程度2100图如下，可以看到样品降解会在快速区、5S区出现波浪状杂峰，基线上抬等现象：

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目前安捷伦2100出的结果图如下：比较重要的指标小编已经在图中注释了，看起来应该比较直观。

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高通量测序对样品要求很高，但并不是要求样品不能有一点降解，一般轻微降解是符合上机要求的，比如在转录组测序中，样品RIN值具体标准如下：动物：RIN≧6.3；植物、真菌：RIN≧5.8，基线平整（软体等无28s物种）；当然，样品合格与否不仅取决于RIN值，还要结合其他指标综合判断。好了，今天RIN值就先介绍到这里，祝您在新的一周里收获多多！