生命科学进展

Nat Commun:相同的基因,相同的条件,不同的运输方式

2020-03-06  本文已影响0人  PaperRSS


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乳球菌它在乳品工业中起着重要的作用,不能产生氨基酸蛋氨酸,必须依赖于环境的摄取。要做到这一点,细菌有两个系统,高亲和力和低亲和力。格罗宁根大学微生物学家发现,克隆群体中生长的细胞在它们所使用的摄取系统上可能有所不同。此外,这两种制度的选择要经过几代人的努力。这是首次在氨基酸吸收途径中观察到这种稳定的异质性。研究结果3月5日发表在《自然通讯》上。


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长期以来,人们都知道,在细菌都是克隆生长(所有细胞都有相同的基因),行为可能有所不同。在严酷的条件下,一些细胞可能通过产生孢自进入生存模式,而另一些细胞则不然。“这是一种避险措施(bet-hedging)”,格罗宁根大学分子遗传学教授奥斯卡·奎珀斯解释道。“形成孢子对于一个细胞来说是代价昂贵的,形成孢子后,他们的条件可能会改善,或者不会。这两条路线都能确保群体能够生存下来。”


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图中,高表达亲和力蛋氨酸转运系统的细胞在荧光绿中发光。这创造了明亮的绿色和黑暗的菌落,但也有部分克隆菌落

犹豫不决

然而,这种策略以前从未在氨基酸运输中被观察到。在Kuipers的监督下,博士生Jhonatan Hernandez-Valdes在不同蛋氨酸浓度的培养基中培养乳球菌。当高亲和力的蛋氨酸转运体被表达时,他向细胞中添加了一个报告基因,使其亮起荧光绿色。然而,在低蛋氨酸条件下,他注意到一些细胞没有发光。

起初,Hernandez-Valdes认为他的细胞培养被污染了。但经过多次检查,发现所有细胞都携带绿色荧光基因--尽管并不是所有细胞都表达了高亲和力的蛋氨酸摄取系统。Kuipers:“我们发现向高亲和力系统的转换非常慢,你可以说细胞对转换犹豫不决。”

避险

进一步的研究表明,T盒核糖体是高亲和力转运体表达异质性的主要原因。显然,使用低或高亲和力转运体对蛋氨酸的摄取没有影响。“这似乎是一个偶然的问题,一个细胞的路线将采取。但一旦作出选择,它仍然是固定的十多代。”

两种摄取系统的细胞在低蛋氨酸条件下都生长良好。那么为什么是异质性呢?Kuipers和他的同事提出了两种可能的解释。第一种是避险,这在细菌和高级生物中都是众所周知的现象。“在自然条件下,不采取高亲和力的运输系统可能会带来一些优势。”菌种中的一些细胞押注于蛋氨酸可用性的增加,而另一些细胞则选择安全的途径,打开高亲和力的系统,即使周围几乎没有蛋氨酸,也能提供他们所需的蛋氨酸。

Kuipers解释说,另一种可能性是存在分工:例如,这两个亚群体相互合作,细胞可能开始分泌蛋氨酸,或死亡和解体,从而使它们的氨基酸可供其他细胞使用。但这种情况是非常投机的。


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“我们知道异质性对细菌是件好事,”他继续说。在一克土壤中可能有数百种不同的菌株,它们都在争夺它们的生态位。“通过将菌群分成两类,你可以更好地预测环境的变化。这始终是一个明智的策略。”

来源:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-15017-1 

https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-03/uog-sgs030320.php


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