RNA-seqNGS

Aspera安装与使用小例子

2018-08-26  本文已影响55人  小明的数据分析笔记本

安装

asper安装.PNG

使用

1.PNG

下载稍微有点麻烦,应该是需要科学上网,自己有时候还找不到下载地址;以上安装和使用方法是自己第一次尝试安装时百度得来的,暂时想不起来出处了,所以就不表明出处啦!

使用Aspera从EBI数据库下载测序数据

教程https://www.ebi.ac.uk/ena/browse/read-download#downloading_files_aspera

实例
~/.aspera/connect/bin/ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR571/008/SRR5714558/SRR5714558_2.fastq.gz ./
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