2020-11-14-19号已做和规划

2020-11-22  本文已影响0人  byejya

开始机器学习:计划在pc机上安装python的两个机器学习相关工具:Keras和scikit-learn,参考书籍:python深度学习 弗朗索瓦·肖莱著  python机器学习基础 动物书

已安装:scikit-learn ,尝试使用。

安装终端cmder并配置Ubuntu:

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尝试数据:1.环形RNA的前列腺组织测序数据/mnt/x110/dingh/prostate-cancer/circRNA    参考基因组:/mnt/T30/zhengy/book/database/hg38   

                                                                                                                                                                        bwa索引:/mnt/x110/guosy/Database/hg19/bwa-index

                    2.找数据下数据

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选择6999003测试

测试:用人的数据,主要是环形RNA的前列腺组织测序数据

完善pe鉴别,阅读文献HSF BPP

明确:我们机器学习做的实际是个分类任务,分类 预测

计划:真菌的写一种方法(参考bpp文章说法“BPs have been successfully predicted in fungal species based on the Hamming distance of the BPS to the U2-complementary sequence (Kupfer et al., 2004)”),植物一种鉴定方法,人类一种。再加上鉴别环形。

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