2020-11-14-19号已做和规划
开始机器学习:计划在pc机上安装python的两个机器学习相关工具:Keras和scikit-learn,参考书籍:python深度学习 弗朗索瓦·肖莱著 python机器学习基础 动物书
已安装:scikit-learn ,尝试使用。
安装终端cmder并配置Ubuntu:
1 2尝试数据:1.环形RNA的前列腺组织测序数据/mnt/x110/dingh/prostate-cancer/circRNA 参考基因组:/mnt/T30/zhengy/book/database/hg38
bwa索引:/mnt/x110/guosy/Database/hg19/bwa-index
2.找数据下数据
112选择6999003测试
测试:用人的数据,主要是环形RNA的前列腺组织测序数据
完善pe鉴别,阅读文献HSF BPP
明确:我们机器学习做的实际是个分类任务,分类 预测
计划:真菌的写一种方法(参考bpp文章说法“BPs have been successfully predicted in fungal species based on the Hamming distance of the BPS to the U2-complementary sequence (Kupfer et al., 2004)”),植物一种鉴定方法,人类一种。再加上鉴别环形。