生物信息学

VCF文件的可视化:VariantQC

2019-08-28  本文已影响0人  wo_monic

类似于FastQC,VariantQC同样是产出html界面。
VariantQC是基于GATK4开发的DISCVRSeq的其中一个java包。
VariantQC的教程
VariantQC文档

git clone https://github.com/BimberLab/DISCVRSeq/

##需要构建索引文件

java -jar DISCVRseq.jar VariantQC -O output_file -R ref.fa -V variant.vcf
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