VCF文件的可视化:VariantQC
2019-08-28 本文已影响0人
wo_monic
类似于FastQC,VariantQC同样是产出html界面。
VariantQC
是基于GATK4开发的DISCVRSeq
的其中一个java包。
VariantQC的教程
VariantQC文档
git clone https://github.com/BimberLab/DISCVRSeq/
##需要构建索引文件
java -jar DISCVRseq.jar VariantQC -O output_file -R ref.fa -V variant.vcf