GMX中常见小错误汇总

长期更新

2018.10.29

Q: gmx genion命令：往溶剂中添加离子时报错："No line with moleculetype SOL found the [ molecules ] section of file "topol.top"

A: 首先检查拓扑文件是否正确，如果在拓扑没有问题的情况下依然报错，往往可能是由于拓扑文件在Windows系统下处理过，行尾标记有问题。用dos2unix工具处理一下拓扑文件即可。