EDTA 安装备忘

2020-10-10  本文已影响0人  吴十三和小可爱的札记

简介

EDTA 是一个集合了LTR预测工具,TIR预测工具,MITE预测工具和Helitrons预测工具的自动全基因组TE注释和TE注释结果检测的综合性的流程。

安装

conda安装

conda create -n EDTA
conda activate EDTA
conda install -c bioconda -c conda-forge edta

报错

  1. Error: gt is not found in the genometools path !


找到问题,但搜索genometools时它在EDTA环境中,推测可能是没有执行权限?

chmod u+x .../miniconda3/.../genometools

解决~~!

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