2022-06-05多序列比对教程
2022-06-05 本文已影响0人
麦冬花儿
1、格式化数据库
makeblastdb -in genome.pep -dbtype prot
2、序列比对(筛选blast最优结果)
blastp -query AP2.fa -db /home/data/t040212/work/01liuningwei/01rnaseq/pep.fa -outfmt 6 -max_hsps 1 -num_alignments 1 -out ap2.tab -evalue 1e-5 -num_threads 8
