调试R的工具包

R作为开源数据分析软件，世界各地的开发者贡献了海量的工具包(Package)。为了验证分析结果或理解其计算过程，常常需要对工具包进行调试(Debug)，在源代码中设置断点、对程序语句进行追踪。我最近对R的一个工具包源代码进行了调试，下面简单介绍其配置过程。由于仅靠回忆，有些地方可能不太准确。

• 安装RStudio。RStudio用来调试R代码非常方便，它有开源版本，可以免费下载。
• 下载待调试R工具包的源代码(Source Code)，R工具包在CRAN网站上都提供了源代码版(Source)以及二进制版(Binary)。下载后解压该.tar.gz文件到文件夹。
• 在RStudio里新建Project，选择上一步的解压文件夹作为Project文件夹。选择菜单 Tools: Project Options，在Build Tools选项页下有提示，需要配置C编译工具，RStudio会自动安装RTools(我记不清是在哪一步后会自动安装)。
• 需要安装MikTex，否则Build工具包时会提示“pdflatex not available”。安装MikTex后需要将其路径添加到系统的环境变量里。另外还需要安装三个MikTex包：natbib, fancyvrb以及supp-pdf.mkii，其中第一个包网上只有源文件，需要在DOS下用tex命令把.ins文件生成.sty文件。MikTex安装文件包后，需要在Settings对话框General选项卡里点击Refresh FNDB。
• 在RStudio右上方面板里选Clean and Rebuild，它就会把Project文件夹里的工具包进行编译链接。
• 在RStudio里新建.R文件，在程序里调用该工具包里的函数(不要使用library加载该工具包，但需要安装该工具包的binary版本，这样能保证其依靠的工具包都已安装)。在工具包里某个函数里设置断点，在RStudio左上方面板点击Source按钮。新建的.R文件就会被运行，并进入到工具包里设置的断点处。RStudio右上方面板会显示调试时各变量的值(一般建议选Grid模式而非List)。对于复杂的变量，可使用str命令来显示变量的组成。