生信分析 找了两年的预后marker+分子对接的思路,它来了
2021-02-25 本文已影响0人
概普生信
19年我们在北京做分子对接培训的时候,就有很多客户问我们,临床生信就是找各种marker的,学习这个有啥用。
小编从那时就开始找生物信息筛选marker和分子对接的思路。
终于找到了,bia给大家。
给大家分享一篇条理清晰干湿结合的好文章(杂志:International Journal of Biological Sciences IF:4.858),文章对 1、如何寻找结直肠癌铁死亡因子 2、如何基于筛选到的铁死亡因子寻找潜在治疗疾病药物3、如何指导实验 做了详细描述,感兴趣仔细听!
没食子酸能够抑制与结直肠癌预后相关的铁死亡相关基因1、筛选结直肠癌种差异的铁死亡因子(数据集:TCGA 阈值:p <0.05 and |log2 fold change (FC)| >1)
2、差异铁死亡因子PPI网络构建及功能、通路分析(C图不太常见)
3、差异铁死亡因子预后分析
4、差异铁死亡因子相关性分析及表达差异验证(GEO数据集)
5、预后相关铁死亡因子GSEA分析
6、预后铁死亡因子与没食子酸分子对接分析
7、细胞系实验验证没食子酸对结直肠癌的作用
8、实验验证没食子酸对结直肠癌预后因子表达的影响
9、动物实验验证没食子酸对结直肠癌的作用
铁死亡跟癌症相关之外还与众多的非肿瘤疾病相关,对铁死亡、分子对接感兴趣的小伙伴记得联系哦!
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