学习小组day3笔记-luckyyy_
2020-03-29 本文已影响0人
luckyyy_

一.linux如何安装软件
1.conda-“linux的应用商店”与app store-“苹果”的关系一样
2.给服务器下载miniconda(conda的精华版)
3.安装和配置miniconda
4.使用miniconda,查看已安装的软件,搜索,安装及卸载生信所需软件
二.下载miniconda
1.查看服务器位数,输入uname -a
2.wget命令 下载conda

三.安装miniconda
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bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh


2.记得要安装完之后还需要激活~
命令行输入conda,出现满屏的信息就是激活成功啦

3.添加镜像
将讲义中所提供的代码粘贴到linux,再回车

conda已经下载和安装完成啦,接下来使用conda
四.开始使用conda
1.查看当前所有软件列表:conda list

2.搜索软件:conda search fastqc

3.安装软件:conda install fastqc -y(-y是自动安装)


4.卸载软件:conda remove fastqc -y

五.conda环境
1.查看当前conda有哪些环境:conda info --envs(*为默认)

2.建立名叫rnaseq的conda环境,制定python版本为3,安装软件fastqc,trimmomatic:
conda create -n rnaseq python=3 fastqc trimmomatic

3.创建完之后,再看下我们的conda环境

4.激活新的conda环境:conda activate rna-seq


以上就是今天的学习笔记啦~谢谢花花的讲解。