R语言版本升级以及Bioconductor更新

1. 升级R语言版本

   1. 安装installr：install.packages("installr") ，如果已经安装了就略过这一步
   2. 升级：installr::updateR()
   3. 一路下去就可以了，我是在RStudio中进行的，注意一点就是中间有一布提示是否打开rGUI，这一步点No。

   4. 注意同意把原来的安装包复制到新的版本中

2. 升级Bioconductor

   1. 命令：BiocManager::install(version = "3.9")
   2. 升级完成后会提示升级相关的安装包，点击yes即可。
   3. 查看安装包的位置命令：.libPaths()
   4. 查看Bioconductor版本命令：BiocManager::version()

3. R包的更新
   命令：update.packages()

4. 从GitHub上安装R包

   1. install.packages("githubinstall")
   2. library("githubinstall")
   3. install_github('packageName')
   4. githubinstall包是用来从GitHub下载R包而专门开发的包，for直接从GitHub下载要指定仓库名

备注：一开始用的是官方的命令

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()
提示错误如下：Error: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'
//意思是现在的R语言版本高，无法运行Bioconductor 的相关命令