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2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析肿瘤

2020-02-20  本文已影响0人  卅衣

因为在网上看了一些视频,然后用数据试了一下,发现一直在运行,打开代码一看,发现是我看不懂的,也不知道哪错了,在网上搜了半天,不是要钱就是故意给你改错的,网页版的注册还不成功,换成英文搜了一遍,发现还是外国人好,现在分享给大家学习一下。

PubMed

PubMed上有一篇文章,专门介绍了CIBERSORT的使用说明


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我们使用的时候,安装好需要的包,然后将文件和CIBERSORT.R放到同一个目录下,运行下面的语句


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CIBERSORT.R

这个是在https://rdrr.io/github/singha53/amritr/src/R/supportFunc_cibersort.R
这个网站上的,直接复制另存为CIBERSORT.R,打不开的可以看下图

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