生信星球培训第六期

第六学习小组day5-gl

2018-09-21  本文已影响39人  Aloptna

变量

x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意这里是逗号不是分号)
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

数据框

read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件,分隔符为Tab,有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令

注意frame1是变量名,如此次应该输入X

X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列(横着写,这是不够懒也不够优秀却能存在的写法)
X[y] #第y列(竖着写,这是懒惰又优秀的写法)
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
教程里小结说,(这里的X是指的我用过的一个变量名,实际应用要懂得替换。刚才让师姐测试我教程的时候很担忧你们粗暴地复制我的代码,最后啥也没看懂。) 这次我输入的上面用到的X,不知道小洁说替换的意思,是不是如果变量是Y,则此处输入Y

今天操作上没有大的问题,只是最后保存脚本没有顺利进行,按照教程所指位置点击没有反应。还有保存所有界面到Rdata文件夹看到我电脑上R后缀的不显示,不知道是不是前段时间R安装的不对。还有最近这几天都在用Rstudio输入,不知道安装那个R有什么用。 image.png
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