2022-08-01 LncFinder

安装R包

install.packages("LncFinder")

注意大小写！

使用：

library(LncFinder)

demo_DNA.seq <- seqinr::read.fasta("filter2_transcript_exon.fa")

Seqs <- demo_DNA.seq

result_1 <- LncFinder::lnc_finder(Seqs,

                                  SS.features = FALSE,

                                  format = "DNA",

                                  frequencies.file = "human",

                                  svm.model = "human",

                                  parallel.cores = 1)

write.table (result_1, file ="/lncFinder_result.txt", sep ="\t",row.names =TRUE, col.names =TRUE,quote =FALSE)

转自：生信技能树