生信星球培训第八十七期

学习小组DAY3笔记——shoan

2020-11-01  本文已影响0人  shoan078

linux 如何安装软件

软件下载器 miniconda

  1. 百度/谷歌搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站)
  2. =》进入:
    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
    你会看到linux下面有64-bit(x86_64)、32-bit(x86)两种版本

=〉接下来,查看服务器是多少位的:输入命令 uname -a

=》安装最新版本(latest)

=〉右键-复制下载链接


  1. 操作
    cd ~/biosoft(没有就新建文件夹)
    wget link(如wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-4.0.0-Linux-x86_64.sh

    bash Anaconda3-4.0.0-Linux-x86_64.sh.1
    安装后注意激活
    source ~/.bashrc

下载软件

  1. 查看服务器软件列表
    conda list
  2. 搜索conda软件
    conda search fastqc
    【这里以数据质控软件fastqc为例】
  3. 安装软件
    conda install fastqc -y
  4. 卸载软件
    conda remove fastqc -y

reference:
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4NjU4ODQ2MQ==&mid=2247483691&idx=1&sn=ac34d79497d094764d5d58726d00f07f&chksm=fdf84969ca8fc07f28604ccda852eb6ef92a49eabf2787c5d0e02437fdd75e6bab186ad87c15&scene=21#wechat_redirect

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