2021-06-20 结构依赖的circRNA降解
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circRNA的降解需要核酸内切酶的作用,今天分享的这项研究是关于circRNA结构依赖的核酸酶G3BP1介导的circRNA降解。不过这项研究最初的发现是关于结构化的3’UTR通过与UPF1-G3BP1互作导致降解。而研究则初步探索了其对circRNA的影响,发现UPF1-G3BP1对于结构化的circRNA也同样起作用。
结构依赖的circRNA降解三言两语
1.鉴于UPF1对于RNA的3'UTR的影响,研究者进行了UPF1与3'UTR结构化程度(可以形成高级结构的程度)的关联分析,结果显示,UPF1可以促进3'UTR高结构化RNA的降解。
2.针对UPF1的相关蛋白G3BP1与3'UTR结构化的关联分析也发现其可以促进3'UTR高结构化RNA的降解。
3.进一步的蛋白-蛋白互作分析表明,UPF1与G3BP1对结构化3'UTR RNA的降解作用并不依赖于彼此的直接互作,但依赖于二者的协同,即需要二者同时结合到一个结构化的3'UTR上才能发挥促降解的作用。
4.对于高结构化的circRNA,UPF1-G3BP1同样可以发挥促降解的功能。
5.UPF1-G3BP1介导的RNA降解只依赖于RNA的结构化程度,与RNA序列或者motif无关。
Reference
Fischer, J. W., Busa, V. F., Shao, Y. & Leung, A. K. L. Structure-Mediated RNA Decay by UPF1 and G3BP1. Molecular cell 78 (2020).