基因组坐标区间操作
- 取两个VCF的差集
- LOLA：overlap analysis for enrich
- 跟着官方文档来看看GRanges这个对象
- bamtofastq 将bam文件转成fastq文件
- 从BAM文件提取unmapped reads并转换成fastq格
- 再次理解SAM/BAM操作
- fasta、fastq、vcf、bam、bed、gtf--多种生
- 用 R 中 diff() 函数和 lag() 函数求每个基因中相
- bedtools:bed,vcf,fasta之间的处理工具
- 2019-和刘小泽一起跟着官网学bedtools
- 【生信技能树】sam和bam格式文件的shell小练习
- 理解SAM文件格式以及过滤sam文件
- cytoband坐标+gencode注释一步get基因名
- vcf文件与vcftools（二）
- [11] 7 数据可视化 & 主要涉及 bam 文件转变
- GenomicAlignments: 用R处理+操作BAM文件
- 使用bedtools划分各种条件的bin
- 如何高效地从BAM文件中提取fastq
- 每周文献-190419-植物单细胞BAM重比对以及假基因研究
- BED文件以及如何正确的从UCSC下载BED文件
- 一起来了解一下基因区间RangeData
- 【R - bioconducter练习】
- 用bedtools和bedops对bed文件进行各种运算
- 在R里面对坐标进行映射
- ④改进版 valr实例计算ChIP-seq中Upstream +
- ③ valr实例计算ChIP-seq中Upstream + Ge
- ② valr实例计算ChIP-seq中TSS上下游reads的分
- ① valr: genome interval arithmet
- 从gff3/bed提取intron坐标及正负链信息
- 生信小工具：bedtools的使用(2)
- 生信小工具: Bedtools使用教程(1)
- 使用Pysam操作BAM文件
- Bedtools使用
- 转载soft clip & hard clip in
bedtools bedops bedr 等
