单细胞/空间转录组专题
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- CNGBdb上线下丘脑单细胞图谱平台（Hypo Cell Atl
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- NC | 利用基于子图的图注意力网络，以单细胞分辨率解析空间转录
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- 时空组工具 | SpaTrack：通过最优传输分析推断空间转录组
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- COMMUN BIOL | Chrysalis：利用原型分析解码
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- Nat Methods | CelloType：用于组织图像分割
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- Nat Methods | 单细胞多组学整合算法的基准测试
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- NC | VolcanoSV可通过单分子长读长测序在二倍体基因组
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- 肿瘤研究工具 | PERCEPTION：利用肿瘤单细胞转录组学预
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- scHiCyclePred：利用多尺度交互信息从单细胞 Hi-C
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- NC | SANTO：一种coarse-to-fine的空间组学
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- 单细胞工具 | SCENT：从多模态单细胞数据中识别组织特异性增
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- 时空组工具 | 使用 scCube 模拟空间转录组中的多种变异
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- NC | ezSingleCell：一站式单细胞和空间组学综合分
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- 时空组工具 | SpatialData：一个开放的、通用的空间组
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- 单细胞工具 | cnnImpute：基于卷积神经网络模型的全新s
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- 单细胞工具 | scGPT：利用生成式AI构建单细胞多组学基础模
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- Nat. Biotechnol. | iStar：通过整合空间转
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- 单细胞工具 | 利用CellHint自动协调和整合人类细胞图谱数
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- NC | scSpaMet：用于组织系统生物学的单细胞空间代谢组
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- 单细胞工具 | SnapATAC2：快速、可扩展、多功能的单细胞
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- 2024NAR数据库特刊：时空组+单细胞数据库合辑
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- NC | scRNA-seq数据跨物种整合算法的基准测试和策略指
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- NC | GNTD：以空间和功能关系为依据，利用图引导神经张量分
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- NC | SPACEL：基于深度学习的空间转录组结构表征
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- 单细胞分析工具 | ScSmOP：用于单细胞多组学数据分析的通用
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- 国产空间组分析工具 | NC发表跨平台、多模态空间组学比对与整合
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- 空转分析工具 | Spatial-MGCN：基于注意机制识别空间
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- NAR | STOmicsDB：用于时空组数据共享、分析和可视化
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- 单细胞分析工具 | DeepCCI：用于从scRNA-seq 数
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- NC | METAFlux：从bulk和单细胞RNA-seq数据
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- Nature子刊 | scMerge2：对图谱规模的多样本多条件
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- Nature子刊 | SComatic：从头检测高通量单细胞数据
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- 空转工具推荐 | DIST：利用深度学习增强空间转录组学
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- 热点综述 | 单细胞转录组和空间转录组差异表达分析工具总结
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- NC | 空间转录组学细胞去卷积工具综合测评
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- NC | 使用GraphST对空间转录组进行空间信息聚类、整合和
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- Nature子刊 | 将对应分析（CA）应用于scRNA-seq
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- 数据分析工具推荐 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批
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- BASS：为单细胞分辨率的空间转录组学提供多尺度和多样本分析
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- 热点综述 | 肿瘤微环境中的细胞间通信推断和分析：数据资源和计算
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- Nature子刊 | 空间转录组技术及其发展方向
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- Life Med综述 | 时空组学技术在病理应用中的革命性意义
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- 重磅发布 | 时空组学数据库STOmicsDB，“一站式”赋能时
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- Science Advances：利用iSpatial对全基因组
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- NC：利用SpaceFlow分析组织中细胞的时空模式 | 空转工
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- 空转工具推荐 | 10款空间转录组去卷积工具的综合比较
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- 时空组专辑数据库文献详解 | ZESTA：斑马鱼胚胎发育时空图谱
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- CCST：基于图神经网络对空间转录组数据进行聚类分析
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- 前沿综述 | Nature子刊：空间转录组学的临床和转化价值
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- Nature Methods | 空间转录组与单细胞转录组整合分
