基因组组装
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- Gene Ontology-基因产物功能数据库
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- RepeatMasker:查找基因组上的重复序列
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- Dfam:真核生物转座元件数据库
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- tRNAdb:综合序列和二级结构的tRNA数据库
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- GtRNAdb:tRNA数据库简介
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- barrnap:预测基因组上的核糖体RNA
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- RNAmmer:预测基因组上的核糖体RNA
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- tRNAscan-SE:预测基因组上的tRNA基因
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- Glimmer:识别微生物中的蛋白编码基因
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- ALLPATHS-LG基因组组装软件简介
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- Abyss:基于布隆过滤器的基因组组装软件
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- velvet软件进行基因组组装
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- soapdenovo2进行基因组组装
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- Gerbil:支持GPU加速的kmer count工具
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- SSRIT:简单重复序列识别工具
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- GenomeScope评估基因组大小和杂合度
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- jellyfish:快速计算kmer分布
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- 基因组组装中的kmer究竟是何方神圣
