生物信息软件安装1:Linux软件背景知识
2017-11-14 本文已影响45人
曹务强
在生物信息学的学习过程中,生物信息学软件的安装绝对是一个大坑,在我们的生信学习群中,经常看到有人抱怨,一个软件安装了一天还没搞定。
BLAST软件的各种版本
以BLAST软件为例,我们可以看到,在BLAST软件的下载界面上,有19个文件可选择下载,那么这些文件都是什么意思呢?我们该下载哪个文件进行安装呢?首先,我们要了解一下生物信息学软件的背景知识:
- 以.md5介绍的文件,是用来校验文件的完整性的
- 带macosx字符的,是苹果操作系统的文件
- 带win字符的,是Windows操作系统的文件
- src:源文件,需编译后才使用
- X86:32位操作系统
- x64、x86_64、AMD64:64位操作系统
- .rpm:适用于Radhat、CentOS等发行版
- .deb:适用于Debine、Ubuntu等发行版
在此处,对于Ubuntu系统,我们需选择下载ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz文件。
注:本文为我在《基因课》的学习笔记,使用Markdown写作。