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生物信息软件安装1:Linux软件背景知识

2017-11-14  本文已影响45人  曹务强

在生物信息学的学习过程中,生物信息学软件的安装绝对是一个大坑,在我们的生信学习群中,经常看到有人抱怨,一个软件安装了一天还没搞定。


BLAST软件的各种版本

以BLAST软件为例,我们可以看到,在BLAST软件的下载界面上,有19个文件可选择下载,那么这些文件都是什么意思呢?我们该下载哪个文件进行安装呢?首先,我们要了解一下生物信息学软件的背景知识:

  1. 以.md5介绍的文件,是用来校验文件的完整性的
  2. 带macosx字符的,是苹果操作系统的文件
  3. 带win字符的,是Windows操作系统的文件
  4. src:源文件,需编译后才使用
  5. X86:32位操作系统
  6. x64、x86_64、AMD64:64位操作系统
  7. .rpm:适用于Radhat、CentOS等发行版
  8. .deb:适用于Debine、Ubuntu等发行版

在此处,对于Ubuntu系统,我们需选择下载ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz文件。

注:本文为我在《基因课》的学习笔记,使用Markdown写作。

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