基因组组装评估

(1) 序列一致性评估

较高的mapping rate（90%以上）以及coverage（95%以上）认为组装结果和reads有比较好的一致性;

(2) 序列完整性评估

所谓完整性评估，即评估组装得到的基因组对基因区的覆盖程度。
50%的scaffold覆盖基因的95%以上，85%的scaffold覆盖基因的90%以上，认为组装较完整。

(3)保守基因评估

保守蛋白家族集合（248个core gene库），评估组装基因组中的core gene的准确性和完整性。可以通过该物种和同源物种cegma的比例，判断保守基因组装情况。

(4) 准确性评估

通过BAC序列（红线），scaffold序列（蓝线），scaffold上的gap区（空白区），看到组装结果和BAC序列有很好的比对结果。