基因组
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- minimap2 简单笔记
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- 2019年11月bioRxiv生信好文速览
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- 利用NextDenovo进行三代组装（四个组装软件结果比较）
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- Masked/Soft Masked/Unmasked，傻傻分不
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- GRCh37 --> GRCh38，参考基因组版本更新到底更的什
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- 2020年进化生物学和生态学领域会议预告
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- 整理一下重复序列屏蔽
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- 开放获取及其影响下的plan S
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- 文献笔记四十九：Chromosomer利用参考基因组序列提升自己
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- RepeatMasker屏蔽重复
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- 叶绿体基因组组装软件NOVOPlasty使用简介
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- 利用purge_haplotigs去杂合
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- MECAT2组装三代基因组
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- 全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）
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- 利用jcvi绘制点图时遇到latex报错
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- Flye (19 Sep 2019) - 三代测序拼接
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- FinisherSC升级基因组—你还在用MUMmer3?
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- 一个高杂合真菌基因组组装脚本（改代码版）
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- ALLHiC续: 如何构建Allele.ctg.table
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- 使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装
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- 札记02-VCF
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- 使用nextpolish对三代组装进行polish
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- 利用LTR_retriever整合LTR数据集
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- 分享一段基因组测序数据比对和变异检测的“代码”
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- 使用NextDenovo组装Nanopore数据
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- 「BioNano系列」如何进行cmap之间的比对
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- NECAT: Nanopore数据的高效组装工具
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- falcon组装及polish
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- 对组装之后的三代基因组进行polish
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- 2019年9月bioRxiv生信好文：基因编辑婴儿事件再发酵
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- WGS全基因组分析||VCFTOOLS使用
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- 三代组装之flye
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- 如何用点图展示MUMMER的结果
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- WGS全基因组分析 || SNP过滤
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- 追鲨鲸魂——三篇文章共解地球上吨位最大鱼类基因组
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- 再谈全基因组倍增的判断标准（原载于2019年7月）
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- hg19和hg38坐标转换
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- 六倍体小麦重测序WGS分析-染色体拆分，snp，indel，sv
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- 物种进化树构建
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- OrthoFinder寻找同源基因并建树（2）
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- WGS分析笔记（6）—— call CNV 和一些其他
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- 使用wgd进行全基因组复制分析
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- 使用TransDecoder寻找转录本中的编码区
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- RAxML进化树构建的新一代——raxml-ng
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- HiC-Pro: Hi-C数据预处理高效工具
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- PNAS研究揭示多倍体在昆虫进化中的普遍性——兼谈多倍体现象与基
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- 人类基因组究竟有多少基因
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- 跳跃的基因——关于转座子你应该了解的十一件事
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- 利用3D-DNA流程基于Hi-C提升基因组组装
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- 基因组注释详解
基因组学与比较基因组学
