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snpEff注释vcf前构建库的Error :CDS check
ggplot的热图玩法
转录组分析中—用R语言画带基因名标签的PCA主成分分析图
R语言ggplot2一幅漂亮的哑铃图
文章解析 | 萝卜泛基因组揭示萝卜属种间种内的遗传变异和基因渗入
[富集分析] 4、clusterprofile富集分析--多组设
不完全谱系分选
【R语言】热图绘制-heatmap函数+默认配色方案
bioconvert:各种各样的生物信息数据格式转换工具
ggplot2绘制GO富集分析柱状图
Science:929个基因组数据揭示人类遗传变异和种群历史
一文看懂如何用QUAST评估组装的基因组
基因型数据填充(imputation)流程知多少
ggpubr包绘制SCI文章图(基础知识)
R 数据可视化 —— ggsci 配色
【豆科基因组】鹰嘴豆Chickpea (Cicer arieti
snp密度图、treemix、D检测
每周文献 2021-05-25
R 数据可视化 —— igraph 函数应用
韦恩图UpSetR;比传统韦恩图更加清晰
跟着Nature Genetics学画图:R语言ggtree可视
群体选择信号分析
diploS/HIC鉴定选择信号
使用sequenceserver搭建本地化blast网页服务
localPCA选择信号分析
OrthoMCL鉴定直系同源基因
SwiftOrtho鉴定同源基因
用qpGraph估计群体混合程度
qpAdm进行群体结构估计
基于VCF文件做基因渗入分析(Dsuite)
pi, Fst, dxy, fd的计算
使用AdmixTools(admixr)做D-statistic
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic
EEMS推测生境内生物的基因流
Mosdepth检测BAM深度
基于Vcf文件进行基因单倍型分析
ggpubr——绘制SCI发表级的各种散点图
连锁不平衡(LD)分析
2021-03-26orthofinder寻找直系同源基因
Pannzer2 | 推荐一款强大的Gene Ontology注
2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析
2021-01-03如何绘制选择性清除图(fst、pi、taji
2021-01-01-LD杂谈
R包goseq的GO富集分析(有参情形)
批处理!功能富集分析、基因ID转换、查找同源基因、SNP注释一站
snpEff使用说明(下)-SnpEff注释SNP/INDEL
持续改进 | 全基因组特征标记可视化 - TBtools
2020-09-28-群体遗传学–Fst指数
可能会用到的R语言包~2
snpEff使用说明(上)-了解及创建SnpEff注释数据库
延伸阅读
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愚人节
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