全基因组/外显子组测序分析
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- 2023-MutationalPatterns包学习笔记（一）
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- 跟着NC做基因组数据分析
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- 取两个VCF的差集
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- 外显子WES数据检测CNV方法梳理与软件汇总
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- 用R语言对vcf文件进行数据挖掘.5 vcf可视化1
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- TCGA 数据分析实战 —— CNV 与突变
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- 家系分析软件汇总
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- 如何用Conda安装GATK？
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- 单个vcf文件转maf文件，单样本maf合并成多样本maf文件
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- CNV拷贝数变异分析（GISTIC、maftools）
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- 多组学文献精读06 | 在10389 个成人肿瘤中致病性胚系突变
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- GISTIC2.0的使用
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- CNV分析学习笔记
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- 肿瘤新生抗原预测软件和参数选择
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- 基于short reads的结构变异鉴定工具的综合评价
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- TCGA-15.突变数据分析-mutation signafit
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- 使用GATK从RNA-seq数据中call variants
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- TCGA 拷贝数变异（CNV）分析
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- R语言中操作vcf文件的一个实例—vcfR包
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- SNP功能注释网站合集
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- WGS分析笔记（6）—— call CNV 和一些其他
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- maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总，分析和可视化
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- 你知道如何比较两个VCF文件吗？
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- GATK4.0全基因组和全外显子组分析实战
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- 徒手学习facets CNV分析结果
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- 徒手学习sequenza CNV分析结果
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- vcf文件与vcftools（二）
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- 多个fasta文件中去除重复序列
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- 比较两个fasta文件是否相同
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- kggseq软件用于测序后下游分析
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- WGS分析用breakdancer找染色体结构变异
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- CNVnator软件使用与示例
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- neoantigen计算机预测的一般流程简介
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- DeepVariant — step3 DeepVariant、
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- 使用snpEff注释vcf文件的小实例
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- [文献阅读]Correlation of Somatic Mut
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- 7 比对到参考基因组输出bam文件
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- 在超算上用sentieon快速完成NGS的变异检测
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- 7 对比对和变异结果用IGV进行可视化
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- GATK4.0和GATK3.5 Call SNV的差异
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- 基因组的那些事儿(二)
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- 6 GATK4完整流程
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- 5 trim_galore去接头
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- 不要"太重视“fastqc的结果
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- 「简化基因组」如何过滤用GATK分析得到的SNP
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- GATK Best Practices — step4 转录组S
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- 全外显子测序(wes)数据分析详细流程(小样本)
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- 「博客翻译」SNP过滤教程（二）
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- 「博客翻译」SNP过滤教程（一）
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- 5月week1:肝癌全基因组变异landscape
利用全基因组和外显子组测序分析snv,cnv,sv等突变形式
