NGS避坑指南
- 生存分析在线工具
- RNA-seq中的常见问题汇总
- 为什么我的基因富集不到某个看似明显的通路？
- 到底是批次效应还是真实生物学差异
- 你以为细胞聚在一起就是一类细胞吗
- 不是转录组就应该有全局差异
- 学会正确选择多序列比对（coding-sequences）软件
- GSE83521/GSE89143去除批次效应
- 综述-测序时代的结构变异
- Hisat2,bwa,bowtie2,STAR,samtools
- 公共数据库没有错误吗？
- 关于人类参考基因组的一些认识
- 比PCA高级的t-SNE也存在缺点
- Deep-learning augmented RNA-seq
- 迈向可重复的生信分析
- （避坑）samtools bedcov 和 bedtools c
- 使用MuSiC分析bulk RNA-seq中的细胞组分
- GEO 批次效应就靠一个函数搞定
- 那令人困惑的比对工具选择啊~
- 船新版本 DESeq2 处理大量样本速度显著提升
- 多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正
- 关于GSEA富集结果条目数一跑一变的迷思和恍然大悟
- 讨厌又迷人的reads去重复
- 常用参考基因组—下载站点
- 2019-08-05 一行代码安装Samtools
- 基因结构注释软件PASA安装踩坑记录
- 我需要多少的测序深度才可以？
- 基因组坐标 “0-base” 和 “1-base”
- 多个探针对应一个基因，是求平均值还是保留最大值？
- 如何检查bam文件的完整性？
- FPKM_cutoff
- 比对基本概念
- 不要"太重视“fastqc的结果
- Scale和Normalization的异同
- RPKM/FPKM/TPM/CPM说明
- 针对conda环境中，trinity调用align_and_es
- 你到底会如何数基因的外显子和内含子个数呢
- BBQ(生物信息基础问题37)：当样本转录组普遍变化时RNA-S
- 细数绘制一张全景图所遇到的坑
- samtools老司机的翻车之旅
- 转录组分析中的技术重复或生物学重复检查
- 我是怎么被基因组坑了10000块钱的
- 2019-03-10 转录组分析 之教训 1
- RNA-seq中的那些统计学问题（二）FPKM/RPKM之外的那
- SAM/BAM相关的进阶知识
- 「有趣」基因组上除了ATCGN还能有什么字符
- 「数据质控」为什么read中会有5'接头
- 「Bioconductor」让我们愉快的为自己做一个物种包吧
- 如何判断二代测序的来源平台
- TAIR周期性更新的注释原来不在FTP服务器上
NGS不解的问题，遇见奇葩的问题，收集一下，为了下一代不要再踩坑！！
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